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本文介紹兩種基本氨基酸:甘氨酸(Gly)和丙氨酸(Ala)。這主要是因?yàn)樗鼈兛梢宰鳛?/span>打底氨基酸,給它們添加基團(tuán)可以生成其他種類的氨基酸。
甘氨酸有一種特殊的甜味,所以它的英文名字來(lái)自希臘語(yǔ)glykys(甘甜)。甘氨酸的漢譯不僅有“甜”的意思,而且發(fā)音相近,堪稱“信、達(dá)、雅”的典范。由于甘氨酸的甜味,在食品工業(yè)中常被用作調(diào)味劑,以去除苦味,增加甜味。甘氨酸的側(cè)鏈很小,只有一個(gè)氫原子。這讓他與眾不同。它是一種沒(méi)有手性的堿性氨基酸。
甘氨酸在蛋白質(zhì)中的特點(diǎn)是體積小、靈活。例如,膠原蛋白的三股螺旋構(gòu)象就非常特殊。每?jī)蓚€(gè)殘基必須有一個(gè)甘氨酸,否則會(huì)導(dǎo)致空間位阻過(guò)大。同樣,一個(gè)蛋白質(zhì)的兩個(gè)結(jié)構(gòu)域之間的連接通常需要甘氨酸提供構(gòu)象靈活性。然而,如果甘氨酸足夠靈活,其穩(wěn)定性必然不足。
在α-螺旋的形成過(guò)程中,甘氨酸是擾流劑之一。原因是側(cè)鏈太小,構(gòu)象根本不能穩(wěn)定。此外,甘氨酸常用于制備緩沖溶液。經(jīng)常做電泳實(shí)驗(yàn)的人一定記得。
丙氨酸的英文名字來(lái)自德語(yǔ)乙醛,中文名字比較容易理解,因?yàn)楸彼岷腥齻€(gè)碳,化學(xué)名稱是氨基丙酸。這是一個(gè)簡(jiǎn)單的名字,就像氨基酸的特征一樣。丙氨酸的側(cè)鏈只有一個(gè)甲基,比甘氨酸略大。當(dāng)我畫(huà)出其他18種氨基酸的結(jié)構(gòu)公式時(shí),我給丙氨酸加基團(tuán)。在蛋白質(zhì)中,丙氨酸就像一塊磚,是一種普通的基本建筑材料,與任何人都不沖突。
丙氨酸側(cè)鏈位阻小,位于α-螺旋中,是一種構(gòu)象;β-折疊時(shí)也非常穩(wěn)定。在蛋白質(zhì)工程中,如果想要突變蛋白質(zhì)上沒(méi)有特定靶點(diǎn)的某個(gè)氨基酸,一般可以將其突變?yōu)楸彼幔蝗菀灼茐牡鞍踪|(zhì)的整體構(gòu)象。
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