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2019新型冠狀病毒,即"SARS-CoV-2 (2019-nCoV)",基因組依次編碼棘突蛋白(spike protein,SP)、包膜蛋白(Envelope protein,EP)、膜蛋白(Membrane protein,M)和核衣殼蛋白(Nucleocapsid,NP)。
棘突蛋白(spike protein) 是冠狀病毒最重要的表面膜蛋白,含有兩個(gè)亞基(subunit), S1和S2。其中S1主要包含有受體結(jié)合區(qū)(receptor binding domain, RBD),負(fù)責(zé)識(shí)別細(xì)胞的受體。S2含有膜融合過程所需的基本元件。
Spike 蛋白承擔(dān)病毒與宿主細(xì)胞膜受體結(jié)合及膜融合功能,是宿主中和抗體的重要作用位點(diǎn)以及疫苗設(shè)計(jì)的關(guān)鍵靶點(diǎn)。SARS-CoV-2 (2019-nCoV) 的Spike蛋白與人ACE2互作來感染人的呼吸道上皮細(xì)胞。
核衣殼蛋白是冠狀病毒中含量最豐富的蛋白。在病毒體組裝過程中,N蛋白與病毒RNA結(jié)合并導(dǎo)致螺旋核衣殼的形成。核衣殼蛋白是一種高度免疫原性的磷蛋白,與病毒基因組復(fù)制和調(diào)節(jié)細(xì)胞信號(hào)通路有關(guān)。由于N蛋白的序列保守性和強(qiáng)大的免疫原性,N蛋白常被作為冠狀病毒診斷檢測(cè)工具。
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